Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms