Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnih3Q6ZWS4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnih3Q6ZWS4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms