Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Topbp1Q6ZQF0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms