Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms