Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kcnt1Q6ZPR4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Kcnt1Q6ZPR4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnt1Q6ZPR4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms