Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssx9Q6XAS3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ssx9Q6XAS3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ssx9Q6XAS3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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