Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms