Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl3Q6W5C0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl3Q6W5C0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl3Q6W5C0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl3Q6W5C0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcl3Q6W5C0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl3Q6W5C0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cxcl3Q6W5C0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cxcl3Q6W5C0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cxcl3Q6W5C0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Cxcl3Q6W5C0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcl3Q6W5C0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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