Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rhox8Q6VSS7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rhox8Q6VSS7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms