Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms