Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms