Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rad54bQ6PFE3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms