Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfrlQ6PE55 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfrlQ6PE55 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms