Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85bQ6PDY0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms