Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms