Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg2aQ6P4T0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms