Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Asic1Q6NXK8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms