Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp140Q6NSQ5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp140Q6NSQ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms