Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd11Q6NS46 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms