Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sohlh1Q6IUP1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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