Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms