Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms