Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw2Q6I6G8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms