Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edrf1Q6GQV7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms