Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms