Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca2Q6DIC0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca2Q6DIC0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms