Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp7Q6A4J8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp7Q6A4J8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms