Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cep290Q6A078 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cep290Q6A078 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep290Q6A078 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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