Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzrn3Q69ZS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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