Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3rf1Q69ZI1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3rf1Q69ZI1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3rf1Q69ZI1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3rf1Q69ZI1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3rf1Q69ZI1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sh3rf1Q69ZI1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sh3rf1Q69ZI1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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