Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zcchc2Q69ZB8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zcchc2Q69ZB8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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