Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pkp4Q68FH0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms