Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltcQ68FD5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms