Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ino80dQ66JY2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms