Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VclQ64727 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VclQ64727 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VclQ64727 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms