Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Zfp248Q640N4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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