Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms