Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Polr2kQ63871 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Polr2kQ63871 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms