Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Znf260Q62513 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Znf260Q62513 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Znf260Q62513 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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