Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lcn4Q62472 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Lcn4Q62472 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lcn4Q62472 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lcn4Q62472 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lcn4Q62472 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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