Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga3Q62470 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms