Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sp4Q62445 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sp4Q62445 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms