Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndrg1Q62433 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms