Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sh3gl2Q62420 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3gl2Q62420 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms