Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp1Q62209 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp1Q62209 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms