Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ssr4Q62186 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms