Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SspnQ62147 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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