Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sin3bQ62141 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms