Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Npm1Q61937 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms