Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itga6Q61739 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Itga6Q61739 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms